La gestió de s’Albufera correspon al Govern de les Illes Balears. Una Junta Rectora amb una àmplia representació social és el principal òrgan de participació i control del Parc.
Un equip multidisciplinar de la Conselleria de Medi Ambient i d'ESPAIS DE NATURA BALEAR treballen dia a dia en tasques tan diverses com la gestió, l’educació ambiental, la informació als visitants, l'administració, el seguiment naturalístic, la vigilància, el manteniment i les feines agrícoles i ramaderes.
A s’Albufera, els recursos humans i econòmics estan al servei d’un objectiu prioritari, la conservació i la restauració del patrimoni natural i cultural, que s’ha de fer compatible amb l’ús públic, educatiu i científic, i amb la integració en la realitat socioeconòmica del seu entorn immediat.
Aquestes són les grans línies que guien la gestió de s’Albufera, que es regeix per un Pla Rector d’Ús i Gestió quadriennal, i per plans anuals d’actuacions.
